Untuk mewujudkan tujuan-tujuannya, HIPSI didukung oleh kepengurusan mulai dari tingkat pusat Dewan Pimpinan Pusat (DPP), tingkat propinsi Dewan Pimpinan Wilayah (DPW) dan tingkat kabupaten/kota Dewan Pimpinan Daerah (DPD). Untuk kebutuhan khusus yang dipandang penting, DPD dapat mendirikan HIPSI tingkat kecamatan dengan sebutan Koordinator Pimpinan Cabang (DPC), dengan Surat Keputusan diterbitkan oleh DPD yang bersangkutan.
DEWAN PEMBINA
Ketua : Ir. Aunur Rofiq
Sekretaris : KH. Miftah Faqih
Anggota :
- Dr. (HC) Chairul Tanjung (CEO Trans Media)
- KH. Abdul Ghoffar Rozin (Ketua RMI Pusat)
- KH. Mujib Imron, S.H, M.H. (Wakil Bupati Pasuruan)
- H. Imam Nakhrowi (MENPORA RI)
- H. Hanif Dakhiri (MENAKERTRANS RI)
- KH. Sholahudin Masruri (Pengasuh Pon.Pes Al-Hikmah Benda)
- KH. Imam Taufik
- KH. Dian Nafis (Pon.Pes Almuayyad Solo)
- H. Zahrul Azhar As’ad (Gus Hans) ( PP. Darul ‘Ulum Jombang)
DEWAN PENASIHAT
Ketua : H. Moch. Ghozali, SE (Pon. Pes Al-Yasini Pasuruan)
Sekretaris : H. Muhammad Nur Hayid (Pesantren Skill Jakarta)
Anggota :
- Dr. Fahrur Rozi (Pon.Pes An-Nur 1 Bululawang)
- KH. Sugeng Utomo (Pon.Pes Dawam Jogja)
- Lukman Tanjung (PT Wijaya Equity)
- H. Amsori Thohir, S.E, Msi. (Pon. Pes An-Nawawi Tanara Banten)
- Shobibah Rohmah Nahrawi
- Mirawati Basri (PT Asia Tech)
- Maya Miranda Ambarsari, SH., MIB
- Dr. H. Arwani Syaerozi, Lc, MA (Pon. Pes babagan Ciwaringin Cirebon)
DEWAN PAKAR
Ketua : H Solahul Am Notobuwono (Pon. Pes Bahrul Ulum Tambak Beras)
Sekretaris : H. Zaenal IPB
Anggota :
- Saidah Sakwan, MA.
- Dr. H. Ahmadin Lutfi Maksun
KETUA UMUM : Sulaiman
SEKRETARIS JENDRAL : Muh Imaduddin Masruri
Wasekjen I : Taufik Mahmud, MA (Banten)
Wasekjen II : Salamus Solikhin. S.Kom. (Lampung)
Wasekjen III : Agus Ali Wasiin (Nganjuk)
Wasekjen IV : Rizky Arlinda, S. AB (Jombang)
BENDAHARA UMUM : Abdul Basit Baedlowi (Jakarta)
Wabendum I : Munawaroh, S Th.I (DIY)
Wabendum II : Andi Indartati, S.Pi (Kendari)
Wabendum III : H. Badruttamam (Surabaya)
Wabendum IV : Nur Muhammad Nafiturohman Asshofi, SH (Jombang)
Waketum I : H. Buchori Al Zahrowi (DIY)
- Departemen Organisasi, Kaderisasi dan Keanggotaan
- Departemen IT, Publikasi dan Media
- Departemen Hubungan Pesantren & Sosial Kemasyarakatan
- Departemen Pemberdayaan Perempuan
- Departemen HIPSI Campus
- Departemen Pendidikan dan Pelatihan Wirausaha Pemula
- Departemen Ekonomi Kreatif
Waketum II : Anang Efendi (Nganjuk)
- Departemen Perindustrian dan Perdagangan
- Departemen Pertanian dan Peternakan
- Departemen Perkebunan dan Kehutanan
- Departemen Perikanan, Maritim, dan Kelautan
- Departemen Koperasi dan Pengembangan UMKM
- Departemen Penelitian & Pengembangan (LITBANG)
Waketum III : Lukman Hakim, SE, M.Ak. (Surabaya)
- Departemen Ritel Distribusi dan Logistik
- Departemen Industri Financial dan Fintech
- Departemen Property & Infrastruktur
- Departemen Kerjasama Hub Pemerintahan & BUMN
- Departemen Kerjasama Luar Negeri
- Departemen Haji Umroh dan Pariwisata
- Departemen Bantuan Hukum HIPSI
DEPARTEMEN
- Gus Wahab (PP. Bahrul Ulum Jombang)
- Rudianto
- Ari Hardianto (Banten)
- Hanan Majdy (Tambak Beras)
- Taufik Abdurrahman (Jogja)
- Fendy (Jogja)
- Ning Iffah (Jogja)
- Surotul Ilmiyah (Banten)
- Rahmatullah, M.Pd.I (Banten)
- Muhammad Zakki (Demak)
- Ir. Taufik Setyadi. MBA.MP. (Sby)
- Purnomo
- Muh Ihsan Mukhlason, SH.I.,MH
- Abd. Wahid Hasyim, SH.MH
- Hariyanto, SH.MH
- Ali Mustofa, SH,MH